復合微生物肥料和生物有機肥的生產(chǎn)工藝基本相似，添加無機養(yǎng)分的部分和有機無機復混肥料的生產(chǎn)工藝相同，只是在烘干溫度上存在差異。同時采用的微生物菌種要具有較高的耐受性，否則在高濃度的無機養(yǎng)分下很難存貨。某種意義上講，復合微生物肥料是生物有機肥和有機-無機復混肥生產(chǎn)工藝的結(jié)合體。圖7-7為粉狀符合微生物肥料的生產(chǎn)工藝流程圖，圖7-8為顆粒狀符合微生物肥料的生產(chǎn)工藝流程圖，由于在造粒和烘干環(huán)節(jié)會造成部分功能微生物死亡，當活菌數(shù)不能滿足產(chǎn)品質(zhì)量要求時，就需要在造粒過程或篩分計量系統(tǒng)再次添加生物菌劑，以保證最終產(chǎn)品中的功能微生物活菌數(shù)等滿足質(zhì)量和技術指標的要求。